1) разработка и реализация в соответствии с законодательством Российской Федерации и Республики Карелия, совместно с заинтересованными федеральными и республиканскими органами исполнительной власти в пределах их компетенции мер по государственному регулированию производства сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия, продовольственного рынка, обеспечению агропромышленного комплекса материально-техническими ресурсами, обеспечению безопасности пищевых продуктов и качества сельскохозяйственной продукции, а также по развитию инвестиционной деятельности, производственной, социальной и инженерной инфраструктуры, обеспечению социальной защиты работников и охраны труда в агропромышленном комплексе;

2) содействие формированию в агропромышленном комплексе рыночных отношений, развитию предпринимательства, кооперации, агропромышленной интеграции, организации рынка сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия;
3) участие в разработке и реализации мер по государственному регулированию экспорта и импорта сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия, обеспечению защиты интересов отечественных товаропроизводителей в сфере агропромышленного производства при осуществлении внешнеэкономической деятельности;
4) проведение аграрных преобразований
5) проведение государственной политики и осуществление государственного управления и контроля в области охраны, воспроизводства и использования объектов животного и растительного мира и среды их обитания, а также в пределах компетенции Министерства - в области охраны окружающей природной среды республики Карелия;
6) проведение государственной политики и осуществление государственного управления в области обеспечения плодородия земель сельскохозяйственного назначения, химизации и мелиорации земель, карантина растений и семеноводства сельскохозяйственных культур, защиты сельскохозяйственных растений от вредных организмов, племенного животноводства, использования, а также в пределах своей компетенции - в области предупреждения и ликвидации последствий чрезвычайных ситуаций в агропромышленном комплексе;
7) формирование и обеспечение реализации единой научно-технической и инновационной политики, содействие развитию науки и формированию механизмов государственной поддержки научно-технической и инновационной деятельности в агропромышленном комплексе, интеграции науки и образования, организации подготовки кадров;
8) содействие развитию взаимовыгодных экономических и научно-технических связей с зарубежными странами по вопросам агропромышленного комплекса;
9) проведение государственной политики в области развития инженерно-технической системы агропромышленного комплекса.
10) реализация государственной политики, направленной на развитие рыбохозяйственого комплекса РК, с целью увеличения рыбной продукции, осуществление координации мероприятий по охране, воспроизводству рыбных запасов, регулированию рыболовства и рациональному использованию запасов рыб и других водных животных и растений. Организация совместно с научными учреждениями исследовательских работ по изучению динамики численности, биологии, поведения рыб и других объектов промысла , объемов допустимых уловов, а также разработок биологически обоснованных режимов рыболовства и промысла водных животных и растений, включая аквакультуру и товарное рыбоводство на внутренних водоемах Карелии.
11) Разработка и подготовка предложений по формированию основных принципов политики РК в области международного и межрегионального сотрудничества по рыбному хозяйству, по распределению общих допустимых уловов для организации любительского и спортивного рыболовства, для рыболовства в целях обеспечения традиционного образа жизни коренных малочисленных народов Севера.
12) Координация деятельности организаций, учреждений и предприятий, зарегистрированных и входящих в рыбохозяйственный комплекс Республики Карелия, а также содействие предпринимательской деятельности.
13) Участие в формировании инвестиционной политики в области развития сельского, рыбного хозяйства и экологии в республике Карелия.